Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nicn1Q9CQM0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nicn1Q9CQM0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms