Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rwdd1Q9CQK7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms