Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms