Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.9 ms