Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ubqln4Q99NB8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ubqln4Q99NB8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ubqln4Q99NB8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ubqln4Q99NB8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ubqln4Q99NB8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ubqln4Q99NB8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ubqln4Q99NB8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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