Protein–RNA interactions for Protein: Q99MZ7

Pecr, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PecrQ99MZ7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PecrQ99MZ7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PecrQ99MZ7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms