Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Prss29Q99MS4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Prss29Q99MS4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms