Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf34Q99KR6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms