Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ophn1Q99J31 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ophn1Q99J31 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms