Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Smim11aQ99J19 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Smim11aQ99J19 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Smim11aQ99J19 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Smim11aQ99J19 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Smim11aQ99J19 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Smim11aQ99J19 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim11aQ99J19 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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