Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim7Q923T7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim7Q923T7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms