Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tubb6Q922F4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms