Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Supt16hQ920B9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Supt16hQ920B9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Supt16hQ920B9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms