Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde6cQ91ZQ1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms