Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms