Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atl3Q91YH5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atl3Q91YH5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms