Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms