Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rhbdd2Q8VEK2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms