Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Stx18Q8VDS8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Stx18Q8VDS8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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Stx18Q8VDS8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx18Q8VDS8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Stx18Q8VDS8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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