Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Fam20bQ8VCS3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Fam20bQ8VCS3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam20bQ8VCS3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms