Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms