Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC6

Ccm2l, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2lQ8VCC6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2lQ8VCC6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms