Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Trappc12Q8K2L8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc12Q8K2L8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Trappc12Q8K2L8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Trappc12Q8K2L8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Trappc12Q8K2L8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Trappc12Q8K2L8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Trappc12Q8K2L8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Trappc12Q8K2L8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms