Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Abcf3Q8K268 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms