Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1M4

Glis1, Zinc finger protein GLIS1, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis1Q8K1M4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Glis1Q8K1M4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Glis1Q8K1M4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms