Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms