Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Col6a6Q8C6K9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Col6a6Q8C6K9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Col6a6Q8C6K9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a6Q8C6K9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Col6a6Q8C6K9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a6Q8C6K9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms