Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg16l1Q8C0J2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg16l1Q8C0J2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms