Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim35Q8C006 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms