Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Vipas39Q8BGQ1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Vipas39Q8BGQ1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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