Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htatsf1Q8BGC0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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