Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ7

Snx32, Sorting nexin-32, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx32Q80ZJ7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms