Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms