Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms