Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcd11Q6NS46 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms