Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spty2d1Q68FG3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spty2d1Q68FG3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms