Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
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Ccdc18Q640L5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
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Ccdc18Q640L5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
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Ccdc18Q640L5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc18Q640L5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
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Ccdc18Q640L5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
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Ccdc18Q640L5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc18Q640L5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
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