Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vamp1Q62442 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp1Q62442 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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