Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SnrpcQ62241 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SnrpcQ62241 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SnrpcQ62241 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SnrpcQ62241 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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SnrpcQ62241 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SnrpcQ62241 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SnrpcQ62241 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpcQ62241 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SnrpcQ62241 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SnrpcQ62241 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpcQ62241 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpcQ62241 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpcQ62241 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SnrpcQ62241 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpcQ62241 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SnrpcQ62241 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpcQ62241 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpcQ62241 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpcQ62241 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpcQ62241 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpcQ62241 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpcQ62241 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpcQ62241 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpcQ62241 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpcQ62241 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SnrpcQ62241 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnrpcQ62241 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnrpcQ62241 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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