Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssr4Q62186 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssr4Q62186 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms