Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp4Q61107 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms