Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3Q60803 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms