Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabl6Q5U3K5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms