Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r196Q5SVD5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms