Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdh12Q5RJH3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh12Q5RJH3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms