Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtl5Q5DTT4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms