Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shank3Q4ACU6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shank3Q4ACU6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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