Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa20Q45VN2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms