Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms