Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm28047Q3US59 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms